AT4G02390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : poly(ADP-ribose) polymerase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a DNA dependent nuclear poly (ADP-ribose) polymerase (E.C.2.4.2.30), thought to be involved in post-translational modification . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
poly(ADP-ribose) polymerase (PP); FUNCTIONS IN: NAD+ ADP-ribosyltransferase activity, nucleic acid binding; INVOLVED IN: protein amino acid ADP-ribosylation; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding SAP (InterPro:IPR003034), WGR (InterPro:IPR008893), Poly(ADP-ribose) polymerase, regulatory domain (InterPro:IPR004102), Poly(ADP-ribose) polymerase, catalytic domain (InterPro:IPR012317); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: poly(ADP-ribose) polymerase 2 (TAIR:AT2G31320.1); Has 1052 Blast hits to 1033 proteins in 170 species: Archae - 0; Bacteria - 15; Metazoa - 556; Fungi - 107; Plants - 166; Viruses - 5; Other Eukaryotes - 203 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:1050104..1053960 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72179.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 637 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANKLKVDEL RLKLAERGLS TTGVKAVLVE RLEEAIAEDT KKEESKSKRK RNSSNDTYES NKLIAIGEFR GMIVKELREE AIKRGLDTTG TKKDLLERLC 101: NDANNVSNAP VKSSNGTDEA EDDNNGFEEE KKEEKIVTAT KKGAAVLDQW IPDEIKSQYH VLQRGDDVYD AILNQTNVRD NNNKFFVLQV LESDSKKTYM 201: VYTRWGRVGV KGQSKLDGPY DSWDRAIEIF TNKFNDKTKN YWSDRKEFIP HPKSYTWLEM DYGKEENDSP VNNDIPSSSS EVKPEQSKLD TRVAKFISLI 301: CNVSMMAQHM MEIGYNANKL PLGKISKSTI SKGYEVLKRI SEVIDRYDRT RLEELSGEFY TVIPHDFGFK KMSQFVIDTP QKLKQKIEMV EALGEIELAT 401: KLLSVDPGLQ DDPLYYHYQQ LNCGLTPVGN DSEEFSMVAN YMENTHAKTH SGYTVEIAQL FRASRAVEAD RFQQFSSSKN RMLLWHGSRL TNWAGILSQG 501: LRIAPPEAPV TGYMFGKGVY FADMFSKSAN YCYANTGAND GVLLLCEVAL GDMNELLYSD YNADNLPPGK LSTKGVGKTA PNPSEAQTLE DGVVVPLGKP 601: VERSCSKGML LYNEYIVYNV EQIKMRYVIQ VKFNYKH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)