AT3G17420.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.997 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : glyoxysomal protein kinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
serine/threonine protein kinase-like protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glyoxysomal protein kinase 1 (GPK1); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT5G18500.2); Has 118798 Blast hits to 117415 proteins in 4321 species: Archae - 113; Bacteria - 14283; Metazoa - 43704; Fungi - 9736; Plants - 32880; Viruses - 449; Other Eukaryotes - 17633 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:5959462..5961313 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52808.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 467 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTSQLKRTLT KRYGVLELWE IIVIALFAAF IVILVLSVWL SFRKKSKRSN ATTLPVTQSP RFTEEIKEIS VDHGSSNNNG TSYQTLDEKF VEDIENGDKF 101: SGSLEKKPLV GSHLPPSTPS TTAPSPLLGL PEVSHIGWGH WFTLRDLQLA TNHFSKESII GDGGYGVVYH GTLTNKTPVA VKKLLNNPGQ ADKDFRVEVE 201: AIGHVRHKNL VRLLGYCVEG THRMLVYEYM NNGNLEQWLH GDMIHKGHLT WEARIKVLVG TAKALAYLHE AIEPKVVHRD IKSSNILMDD NFDAKLSDFG 301: LAKLLGADSN YVSTRVMGTF GYVAPEYANS GLLNEKSDVY SYGVVLLEAI TGRYPVDYAR PKEEVHMVEW LKLMVQQKQF EEVVDKELEI KPTTSELKRA 401: LLTALRCVDP DADKRPKMSQ VARMLESDEY PVMPREERRR RRNQNAETHR ESTDTNKDND ITTDAKI |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)