AT2G34470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : urease accessory protein G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a urease accessory protein which is essential for the activation of plant urease. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
urease accessory protein G (UREG); FUNCTIONS IN: nickel ion binding, nucleotide binding, metal ion binding, ATP binding; INVOLVED IN: nitrogen compound metabolic process, positive regulation of metalloenzyme activity; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Urease accessory protein UreG (InterPro:IPR004400), [NiFe]-hydrogenase/urease maturation factor, Ni(2+)-binding GTPase (InterPro:IPR012202), Cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW-like (InterPro:IPR003495); Has 3841 Blast hits to 3838 proteins in 1211 species: Archae - 152; Bacteria - 2767; Metazoa - 198; Fungi - 88; Plants - 54; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 579 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14530900..14532411 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30084.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 275 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASHDHHHHH HDHEHDHEKS DGGEGKASWV GKDGKVYHSH DGLAPHSHEP IYSPGYFSRR APPLHDRNFS ERAFTVGIGG PVGTGKTALM LALCRFLRDK 101: YSLAAVTNDI FTKEDGEFLV KNGALPEERI RAVETGGCPH AAIREDISIN LGPLEELSNL FKADLLLCES GGDNLAANFS RELADYIIYI IDVSAGDKIP 201: RKGGPGITQA DLLVINKTDL AAAVGADLSV MERDSLRMRD GGPFVFAQVK HGLGVEEIVN HVMHSWEHAT GKKRQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)