AT2G32900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.841 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : centromere/kinetochore protein, putative (ZW10) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
homologous to Drosophila ZW10, a centromere/kinetochore protein involved in chromosome segregation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATZW10; INVOLVED IN: chromosome segregation; LOCATED IN: chromosome, centromeric region, nucleus; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Centromere/kinetochore protein Zw10 (InterPro:IPR009361); Has 272 Blast hits to 258 proteins in 128 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 125; Fungi - 86; Plants - 38; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 21 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13953807..13957470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 83938.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 742 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPEIDALFES INVRDLLAGH DLNDPTTPLS APDLRLLINR LESHSLRIKS KVQSYLVAHH SDFSELFSLC QDTVSRTRLI SDDVSDVLQL VSDRPIDVEI 101: RSVVDEITEK TKEVKLKRES LDLVNAIVGI CEALQETKEA LKNGRFRFAA ERIRELKVVL RIGEEEDGEP VAYALLRKEW SNCFDEIQEV LAKFMENAVR 201: FELDSSRIRI KYQLSVGETA GIALSTVLEA MEVIGILDYG LAKAADSIFK HVITPAVTHA STFAAVEDLC KSAGEVTEAT LRLEQSSDHK FEDVDGDAMY 301: SGILKVVKFI CSSLCFGNVT WIHSFGRLTW PRISELIISK FLSKVVPEDA SKLADFQKII ERTSQFEAAL KELNFVSSSD AESRLSKYAE DVEVHFASRK 401: KIEILAKARN LLLQCNFTIP QDIAMRNAKH IVCLLFSSER CVVSEAASQL MNLVHKTLED VCVSSARVAS EFYNAARDSI LLYEAVVPVK LEKQLDGLNE 501: AAVLLHNDCL YLFEEILGLA FEYRASFPSS IKEYAVFADI APRFKLMAEE VLQKQVHLVI SSLREAIDSA DGFQNTHQIK QFKSAEFSID QVVFSLKNVH 601: MIWEPVLRPK TYKQSMCAVL ESVFRRIARD ILLLDDMAAD ETFELQKLIY LMLKNLSSVL DSVRSADETS RPLDDIIPSL RKTRKLAELL DMPLMSITSA 701: WESGELFRCN FTRTEVQDFI KAIFTDSPLR KECLWRIDEV NQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)