AT2G17130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : isocitrate dehydrogenase subunit 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a regulatory subunit of the mitochondrially-localized NAD+- dependent isocitrate dehydrogenase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
isocitrate dehydrogenase subunit 2 (IDH2); FUNCTIONS IN: isocitrate dehydrogenase (NAD+) activity; INVOLVED IN: isocitrate metabolic process, tricarboxylic acid cycle, metabolic process; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase (InterPro:IPR001804), Isocitrate dehydrogenase NAD-dependent, mitochondrial (InterPro:IPR004434); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: isocitrate dehydrogenase 1 (TAIR:AT4G35260.1); Has 16085 Blast hits to 15952 proteins in 2729 species: Archae - 398; Bacteria - 9705; Metazoa - 617; Fungi - 814; Plants - 241; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4310 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:7461062..7462466 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39592.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 367 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSRQSFSLLK NLRSIASGSK IQTRSVTYMP RPGDGKPRPV TLIPGDGVGP LVTNAVQQVM EAMHAPVYFE PFEVHGDMKS LPEGLLESIK KNKVCLKGGL 101: KTPVGGGVSS LNVNLRKELD LFASLVNCFN LPGLASRHEN VDIVVIRENT EGEYAGLEHE VVPGVVESLK VITKFCSERI AKYAFEYAYL NNRKKVTAVH 201: KANIMKLADG LFLESCQEVA KKYPSIAYNE IIVDNCCMQL VARPEQFDVM VTPNLYGNLV ANTAAGIAGG TGVMPGGNVG AEYAVFEQGA SAGNVGKDTT 301: EEQKNANPVA LLLSSAMMLR HLQFPSFADR LETAVKRVIA EGNCRTEDLG GNSTTQEVVD AVIANLD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)