AT1G71250.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.984 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein; FUNCTIONS IN: hydrolase activity, acting on ester bonds, lipase activity, carboxylesterase activity; INVOLVED IN: lipid metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, GDSL, active site (InterPro:IPR008265), Lipase, GDSL (InterPro:IPR001087); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein (TAIR:AT5G08460.1); Has 3499 Blast hits to 3462 proteins in 237 species: Archae - 0; Bacteria - 354; Metazoa - 0; Fungi - 36; Plants - 3096; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 13 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:26860125..26861582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41194.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 374 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNTNRKKMKV HIGGYVLILA LTVSVILQQP ELVTGQARVP AMFVLGDSLV DAGNNNFLQT VARANFLPYG IDMNYQPTGR FSNGLTFIDL LARLLEIPSP 101: PPFADPTTSG NRILQGVNYA SAAAGILDVS GYNYGGRFSL NQQMVNLETT LSQLRTMMSP QNFTDYLARS LVVLVFGSND YINNYLMPNL YDSSIRFRPP 201: DFANLLLSQY ARQLLTLYSL GLRKIFIPGV APLGCIPNQR ARGISPPDRC VDSVNQILGT FNQGLKSLVD QLNQRSPGAI YVYGNTYSAI GDILNNPAAY 301: GFSVVDRACC GIGRNQGQIT CLPLQTPCPN RNQYVFWDAF HPTQTANSIL ARRAFYGPPS DAYPVNVQQM TLLH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)