AT1G69960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.788 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : serine/threonine protein phosphatase 2A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
type 2A serine/threonine protein phosphatase (PP2A) mRNA, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
serine/threonine protein phosphatase 2A (PP2A); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Serine/threonine-specific protein phosphatase/bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase (InterPro:IPR006186); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: protein phosphatase 2A-2 (TAIR:AT1G10430.1); Has 6844 Blast hits to 6656 proteins in 515 species: Archae - 80; Bacteria - 271; Metazoa - 2385; Fungi - 1410; Plants - 969; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 1725 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26348892..26350511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35043.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 307 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPPATGDIDR QIEQLMECKA LSETEVKMLC EHAKTILVEE YNVQPVKCPV TVCGDIHGQF YDLIELFRIG GSSPDTNYLF MGDYVDRGYY SVETVSLLVA 101: LKVRYRDRLT ILRGNHESRQ ITQVYGFYDE CLRKYGNANV WKHFTDLFDY LPLTALIESQ VFCLHGGLSP SLDTLDNIRS LDRIQEVPHE GPMCDLLWSD 201: PDDRCGWGIS PRGAGYTFGQ DIATQFNHTN GLSLISRAHQ LVMEGFNWCQ EKNVVTVFSA PNYCYRCGNM AAILEIGENM DQNFLQFDPA PRQVEPETTR 301: KTPDYFL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)