AT5G66170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.840 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulfurtransferase 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a thiosulfate sulfurtransferase/rhodanese. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulfurtransferase 18 (STR18); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rhodanese-like (InterPro:IPR001763); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein (TAIR:AT2G17850.1); Has 200 Blast hits to 200 proteins in 47 species: Archae - 2; Bacteria - 43; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 144; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 11 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:26447828..26448582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14706.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 136 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSQSISSSTK AEEVVSVDVS QAKTLLQSGH QYLDVRTQDE FRRGHCEAAK IVNIPYMLNT PQGRVKNQEF LEQVSSLLNP ADDILVGCQS GARSLKATTE 101: LVAAVRLQES EKRGRWLLGL GGSQLSHQHG GGGAIC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)