AT5G64610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : histone acetyltransferase of the MYST family 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an enzyme with histone acetyltransferase activity. HAM1 primarily acetylate histone H4, but also display some ability to acetylate H3. Prior acetylation of lysine 5 on histone H4 reduces radioactive acetylation by either HAM1. HAM1 acetylates histone H4 lysine 5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
histone acetyltransferase of the MYST family 1 (HAM1); FUNCTIONS IN: histone acetyltransferase activity, zinc ion binding, nucleic acid binding; INVOLVED IN: chromatin assembly or disassembly, regulation of transcription; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Winged helix-turn-helix transcription repressor DNA-binding (InterPro:IPR011991), Acyl-CoA N-acyltransferase (InterPro:IPR016181), Chromo domain (InterPro:IPR000953), MOZ/SAS-like protein (InterPro:IPR002717); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: histone acetyltransferase of the MYST family 2 (TAIR:AT5G09740.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:25828333..25830503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51440.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 445 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSSADTETA MIIATPASNH NNPATNGGDA NQNHTSGAIL ALTNSESDAS KKRRMGVLPL EVGTRVMCQW RDGKYHPVKV IERRKNYNGG HNDYEYYVHY 101: TEFNRRLDEW IKLEQLDLDS VECALDEKVE DKVTSLKMTR HQKRKIDETH VEGHEELDAA SLREHEEFTK VKNIATIELG KYEIETWYFS PFPPEYNDCV 201: KLFFCEFCLS FMKRKEQLQR HMRKCDLKHP PGDEIYRSST LSMFEVDGKK NKVYAQNLCY LAKLFLDHKT LYYDVDLFLF YILCECDDRG CHMVGYFSKE 301: KHSEEAYNLA CILTLPPYQR KGYGKFLIAF SYELSKKEGK VGTPERPLSD LGLVSYRGYW TRILLDILKK HKGNISIKEL SDMTAIKAED ILSTLQSLEL 401: IQYRKGQHVI CADPKVLDRH LKAAGRGGLD VDVSKMIWTP YKEQS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)