AT5G63590.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.654 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : flavonol synthase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
flavonol synthase 3 (FLS3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase (InterPro:IPR005123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: flavonol synthase 1 (TAIR:AT5G08640.2); Has 8006 Blast hits to 7970 proteins in 965 species: Archae - 0; Bacteria - 1024; Metazoa - 86; Fungi - 741; Plants - 4902; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1253 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:25457172..25458427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35453.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 308 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEMEKNQHIS SLDIPVIDLS NPDEELVASA VVKASQEWGI FQVVNHGIPT ELILRLLQVG MEFFELPETE KEAVAKPEDS LDIEGYRTKY QKDLEGRNAW 101: VDHLFHRIWP PSRVNHKFWP KNPPEYIEVN EEYASHIKKL SEKIMEWLSE GLGLRHEALK EGLGGETIEY LMKINYYPPC PDPELVVGAP DHTDVNGITL 201: LVANEALGLQ AFKDNQWIDA EYTTSGIIVI IGDQFLRMSN GKYKSVEHRA KMDKEKTRIS WPVFVESSLD QVFGPLPELI TGDENVPKFK PYVYKDYKFR 301: KLKKLLLD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)