AT5G63580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.825 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : flavonol synthase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a protein whose sequence is similar to flavonol synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
flavonol synthase 2 (FLS2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase (InterPro:IPR005123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: flavonol synthase 1 (TAIR:AT5G08640.2); Has 7130 Blast hits to 7103 proteins in 905 species: Archae - 0; Bacteria - 928; Metazoa - 80; Fungi - 632; Plants - 4738; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 752 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25454730..25456092 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28484.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 250 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEVERDQHIS PPSLMAKTIP IIDLSNLDEE LVAHAVVKGS EEWGIFHVVN HGIPMDLIQR LKDVGTQFFE LPETEKKAVA KQDGSKDFEG YTTNLKYVKG 101: EVWTENLFHR IWPPTCINFD YWPKNPPQYR EVIEEYTKET KKLSERILGY LSEGLGLPSE ALIQGLGGES TEYVMRINNY PPDPKPDLTL GVPEHTDIIG 201: ITIIITNEVP GLQIFKDDHW LDVHYIPSSI TVNIGDQIMA EQWKVQECVA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)