AT5G61760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.992 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : inositol polyphosphate kinase 2 beta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an inositol polyphosphate 3-/6-/5-kinase that is localized to the nucleus. Able to complement a mutation in a yeast transcriptional regulator gene (ARG82/IPK2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
inositol polyphosphate kinase 2 beta (IPK2BETA); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inositol polyphosphate kinase (InterPro:IPR005522); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: inositol polyphosphate kinase 2 alpha (TAIR:AT5G07370.4); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:24813916..24814818 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33488.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 300 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLKVPEHQVA GHIASDGKLG PLVDDQGRFF KPLQGDSRGE HEAKFYESFT SNMKVPDHIH RYFPVYHGTQ LVEASDGSGK LPHLVLDDVV SGYANPSVMD 101: VKIGSRTWYP DVSEEYFKKC IKKDRQTTTV SLGFRVSGFK IFDHQESSFW RAEKKLVLGY NADGARLALR KFVSSNSPAD SNLTPNCAFA SEVYGGCNGI 201: LAQLLELKDW FETQTLYHFN SCSILMIYEN ESILMQGGDD APAPRAQVKL VDFAHVLDGN GVIDHNFLGG LCSFIKFIKD ILQSVEKHDE TDTSLLENGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)