AT2G33470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glycolipid transfer protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
glycolipid transfer protein 1 (GLTP1); FUNCTIONS IN: glycolipid transporter activity, glycolipid binding; INVOLVED IN: glycolipid transport; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycolipid transfer protein, GLTP (InterPro:IPR014830); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glycolipid transfer protein (GLTP) family protein (TAIR:AT3G21260.3); Has 607 Blast hits to 606 proteins in 171 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 298; Fungi - 124; Plants - 134; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 51 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14176599..14177950 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22741.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 202 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGTVFTPCL EGMKHVKSDQ GEMLTKPFLE LCKTILPVID KFGAAMTLVK SDIGGNITRL EKNYLSDPDK FKYLYTFVQV EIESKIAKGS SSCTNGLLWL 101: TRAMDFLVEL FRNLVAHQDW SMPQACADSY QKTLKKWHGW LASSTFSMAL KLAPDRKKFM DVISGSGNIQ ADMERFCAEF GPFLHDNHKF LASVGMDDMK 201: AS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)