AT5G51410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : LUC7 N_terminus domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
LUC7 N_terminus domain-containing protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: LUC7 related (InterPro:IPR004882); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: LUC7 related protein (TAIR:AT3G03340.1); Has 11347 Blast hits to 6019 proteins in 331 species: Archae - 9; Bacteria - 137; Metazoa - 6515; Fungi - 1614; Plants - 1008; Viruses - 20; Other Eukaryotes - 2044 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:20881821..20883577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38723.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 334 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDAQRALLDE LMGAARNLTD EERRGFKEVK WDDREVCAFY MVRFCPHDLF VNTKSDLGAC SRIHDPKLKE SFENSPRHDS YVPKFEAELA QFCEKLVNDL 101: DRKVRRGRER LAQEVEPVPP PSLSAEKAEQ LSVLEEKVKN LLEQVEALGE EGKVDEAEAL MRKVEGLNAE KTVLLQRPTD KVLAMAQEKK MALCEVCGSF 201: LVANDAVERT QSHVTGKQHV GYGLVRDFIA EQKAAKDKGK EEERLVRGKE ADDKRKPREK ESESKRSGSS DRERYRDRDR NRDGDRHRDR GRDYRKPYDR 301: RSRSGREDRD RSRSRSPHGR SGHRRVSRSP IRQY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)