AT5G48520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 nucleus 0.500 ASURE: cytosol,nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; Has 609 Blast hits to 593 proteins in 129 species: Archae - 0; Bacteria - 41; Metazoa - 390; Fungi - 40; Plants - 64; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 74 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:19661407..19666147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69728.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 617 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSARLCSLV AELGYEGAGK LDPDSFEWPF QYDDARPILD WICSSLRPSN VLSLAELSLY EQFQRDGKLL EGDDLDQAYD SISAFSSRRN NQEAVFGAEE 101: SIKEVRDATL AHKAEALELQ RQLRRLQTQY DLLTGQSSAL IQGRRARVAA TSAVSGQITA IEDSLSARNL QMNGVLGRLA STSQELAHYH SGEEDGIYLA 201: YSDFHAYLAG DSACTKELNQ WFAKQLDTGP YRLVAEEGKS KCSWVSLDDT SNMLRDLEKS QHQRVAELQR LRSIFGTSER QWIEAQVENA KQQAILLTLK 301: SQVTSVEAHI HFDLHSLRRK HADLVEEIST LYQKEEKLLS ETIPELCWEL AQLQDTYILQ GDYDLKVMRQ ELYISKQKVF INHLVNQLAR HQFLKLACQL 401: EKKNMLGAFS LLKVIESELQ GYLSATRSRV GRCSALIQAA SDVQEQGAVD DRDSFLHGVR DLLSIHSNTQ AGLSTYVSAP AIIQQIVALQ SDLSSLQSDL 501: ENSLPDDRNR CINELCTHIQ NLQQLLFASS TTAQPILTPW PLMKELDEMG KINSKLSTAV EEVTLEHRNK REIVKHHAKD VELQRRVFVD FFCNPERLRN 601: QVRELNALVR ARQASSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)