AT5G24310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ABL interactor-like protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
One of four ABI-like proteins. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ABL interactor-like protein 3 (ABIL3); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ABL interactor-like protein 2 (TAIR:AT3G49290.2); Has 281 Blast hits to 258 proteins in 44 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 102; Fungi - 8; Plants - 157; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 10 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:8274637..8276325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36682.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 321 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSAAATMPMP REASNYDEIS MQQSMLFSDS LKDLKNLRTQ LYSAAEYFEL SYTNDEQKQI VVETLKDYAI KALVNTVDHL GSVTYKVNDF VDEKVDEVAG 101: TELRVSCIEQ RLRMCQEYMD HEGRSQQSLV IDTPKFHKRY FLPSGEIKRG GNLAKLKNVE GSFDGEDDWN QFRNAVRATI RETPPPPVRK PILQSPSQRK 201: PQRSATFSFS SIATAPKKEQ DKRAVSPHRF PLLRSGSVAI RPSSISRPTT PSKSRAVTPT PKRYPSEPRR SASVRVAFEK EAQKEPEHQQ QPSKSKRLLK 301: ALLSRRKTKK DDTLYTYLDE Y |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)