AT4G27180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : kinesin 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
kinesin heavy chain subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
kinesin 2 (ATK2); FUNCTIONS IN: microtubule binding, microtubule motor activity; INVOLVED IN: microtubule-based movement; LOCATED IN: kinesin complex; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Kinesin, motor region, conserved site (InterPro:IPR019821), Kinesin, motor domain (InterPro:IPR001752); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: kinesin 3 (TAIR:AT5G54670.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13615057..13618689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 84364.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 745 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVGEMTNNGR IRPSFPVKDL TSNEGSEYGG PVEFTREDVE TLLHERIKYK SKYNYKERCE NTMDYVKRLR LCIRWFQELE LDYAFEQEKL KNAMEMNEKH 101: CADLEVNLKV KEEELNMVID ELRKNFASVQ VQLAKEQTEK LAANESLGKE REARIAVESL QAAITEELAK TQGELQTANQ RIQAVNDMYK LLQEYNSSLQ 201: LYNSKLQGDL DEAHENIKRG EKERTGIVES IGNLKGQFKA LQDQLAASKV SQDDVMKQKD ELVNEIVSLK VEIQQVKDDR DRHITEIETL QAEATKQNDF 301: KDTINELESK CSVQNKEIEE LQDQLVASER KLQVADLSTF EKMNEFEEQK ESIMELKGRL EEAELKLIEG EKLRKKLHNT IQELKGNIRV FCRVRPLLSG 401: ENSSEEAKTI SYPTSLEALG RGIDLLQNGQ SHCFTFDKVF VPSASQEDVF VEISQLVQSA LDGYKVCIFA YGQTGSGKTY TMMGRPGNPD EKGLIPRCLE 501: QIFQTRQSLR SQGWKYELQV SMLEIYNETI RDLLSTNKEA VRADNGVSPQ KYAIKHDASG NTHVVELTVV DVRSSKQVSF LLDHAARNRS VGKTAMNEQS 601: SRSHFVFTLK ISGFNESTEQ QVQGVLNLID LAGSERLSKS GSTGDRLKET QAINKSLSSL GDVIFALAKK EDHVPFRNSK LTYLLQPCLG GDSKTLMFVN 701: ITPEPSSTGE SLCSLRFAAR VNACEIGTAH RHVNARPLDY RLSLG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)