AT5G23330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleotidylyl transferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Nucleotidylyl transferase superfamily protein; FUNCTIONS IN: FMN adenylyltransferase activity; INVOLVED IN: riboflavin biosynthetic process; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), FAD synthetase (InterPro:IPR015864); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleotidylyl transferase superfamily protein (TAIR:AT5G08340.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:7854194..7855738 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39212.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 354 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLCGGSRASV HLWDHRHPPR LGAKVLRKSS FMLRPCSAIS QQRIKSSFRS HCKTPRKIPA PLDCFSQGDD HPELSAEGLS PVAGGIVALG KFDALHIGHR 101: ELAIQAARIG TPYLLSFVGL AEVLGWKPRA PIVAKCDRKR VLSSWASYCG NIAPVEFEIE FASVRHLNPQ QFVEKLSREL RVCGVVAGEN YRFGYRASGD 201: ASELVRLCKD FGISAYIINS VMDKNQVSVN TEEEDSKSKE RGQVSSTRVR HALAAGDVRY VTELLGRPHR VISRTRTQDL TSKRGRISLQ TSSLLNLPPG 301: NGVYKACSLI VGDKHPISCK VIVDTSNLYI ETEEERFHNS DESQEFQLLG IEFG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)