AT4G30580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phospholipid/glycerol acyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plastidic lysophosphatidic acid acyltransferase (LPAAT). Is critical for chloroplasts phosphatidic acid biosynthesis. The null allele is embryo lethal. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATS2; FUNCTIONS IN: 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity, acyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process, phosphatidylglycerol biosynthetic process, embryo development ending in seed dormancy; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipid/glycerol acyltransferase (InterPro:IPR002123), 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase (InterPro:IPR004552); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phospholipid/glycerol acyltransferase family protein (TAIR:AT3G05510.1); Has 12571 Blast hits to 12571 proteins in 2517 species: Archae - 0; Bacteria - 9130; Metazoa - 376; Fungi - 153; Plants - 151; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2761 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14932515..14934489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39397.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 356 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDVASARSIS SHPSYYGKPI CSSQSSLIRI SRDKVCCFGR ISNGMTSFTT SLHAVPSEKF MGETRRTGIQ WSNRSLRHDP YRFLDKKSPR SSQLARDITV 101: RADLSGAATP DSSFPEPEIK LSSRLRGIFF CVVAGISATF LIVLMIIGHP FVLLFDPYRR KFHHFIAKLW ASISIYPFYK INIEGLENLP SSDTPAVYVS 201: NHQSFLDIYT LLSLGKSFKF ISKTGIFVIP IIGWAMSMMG VVPLKRMDPR SQVDCLKRCM ELLKKGASVF FFPEGTRSKD GRLGSFKKGA FTVAAKTGVA 301: VVPITLMGTG KIMPTGSEGI LNHGNVRVII HKPIHGSKAD VLCNEARSKI AESMDL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)