AT5G08335.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT) family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an isoprenyl cysteine methylatransferase (ICMT) involved in the post-translational processing of proteins that have a C-terminal CaaX box. This protein appears to have higher catalytic activity and a higher transcript expression level than the other ICMT present in Arabidopsis (At5g23320). Analysis of ICMT RNAi lines suggests that this protein is involved in flower and stem development. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATSTE14B; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (InterPro:IPR007269); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: homolog of yeast STE14 A (TAIR:AT5G23320.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:2683012..2683605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22767.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 197 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTEIFSDTGF RQLTQMFLAI IFFHTSEYIL AIAIHGASKV TLSSLLISKH YALAMLISVL EYIAEIVFFP GLKQHWWISN FGLTMIILGE ILRKTAIITA 101: GRSFTHLIKI RREEHHKLVT EGVYQIMRHP SYSGFLIWSV GTQVMLCNPI SAIAFAVVVW RFFAERIPYE EHYLKQFFGR QYVEYAQRVP SGVPFVN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)