AT5G08160.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.992 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : serine/threonine protein kinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a serine/threonine protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
serine/threonine protein kinase 3 (PK3); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT2G32850.2); Has 44052 Blast hits to 43588 proteins in 1953 species: Archae - 71; Bacteria - 7210; Metazoa - 16296; Fungi - 5509; Plants - 6936; Viruses - 48; Other Eukaryotes - 7982 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:2625903..2627942 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38638.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 347 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGCSFSGLNA LYDAVNGGGD VWINENRFRI VRQLGEGGFA FVFLVKEIVA DASSAASGGG LAKKVKDPAH LSADGTYAMK KVLIQNKEQL ELVREEIRVS 101: SLFNHPNLLP LLDHAIISVK DGQEGAWKHE AFLLFPVHLD GTLLDNFTLM KAKKETFSTT DVLHIFRQLC DGLKHMHSLE PPYAHNDVKP GNVLLTRRKG 201: QPPLAILMDF GSARPSRKQI RSRQEALQLQ EWTSEHCSAP FRAPELWDCP SHADIDERTD IWSLGCTLYA IMYGVSPFEY ALGESGGSLQ LAIVNAQIKW 301: PNTGPKASYP EALHQFVTWM LQPQAAVRPR IDDIIIHVDK LIAKFTK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)