AT2G45010.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : PLAC8 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PLAC8 family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function Cys-rich (InterPro:IPR006461); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PLAC8 family protein (TAIR:AT5G51400.1); Has 558 Blast hits to 557 proteins in 52 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 9; Fungi - 22; Plants - 524; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18568045..18569615 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27265.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 244 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADGNASSRY VKLRKEQAPV EEDITPGELN QPIDVPQLNV RKCHECMQVL PETYEPPSDE NWTTGIFGCA EDPESCRTGL FCPCVLFGRN IEAVREEIPW 101: TQPCVCHAVC VEGGMALAAV TALFSGYIDP QTTVVICEGL FFAWWMCGIY SGLFRQELQK KYHLKNAPCD HCMVHCCLHW CALCQEHREM KNHLSDTEAS 201: SSTTMDPPPV QEMNTEERRD ASSSSSSSPS SAKSQHNDLE MVPL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)