AT5G07010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.995 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulfotransferase 2A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a sulfotransferase that acts specifically on 11- and 12-hydroxyjasmonic acid. Transcript levels for this enzyme are increased by treatments with jasmonic acid (JA), 12-hydroxyJA, JA-isoleucine, and 12-oxyphytodienoic acid (a JA precursor). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulfotransferase 2A (ST2A); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulfotransferase domain (InterPro:IPR000863); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfotransferase 2B (TAIR:AT5G07000.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:2174960..2176039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41366.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 359 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSSMKSIP MAIPSFSMCH KLELLKEGKT RDVPKAEEDE GLSCEFQEML DSLPKERGWR TRYLYLFQGF WCQAKEIQAI MSFQKHFQSL ENDVVLATIP 101: KSGTTWLKAL TFTILNRHRF DPVASSTNHP LFTSNPHDLV PFFEYKLYAN GDVPDLSGLA SPRTFATHLP FGSLKETIEK PGVKVVYLCR NPFDTFISSW 201: HYTNNIKSES VSPVLLDQAF DLYCRGVIGF GPFWEHMLGY WRESLKRPEK VFFLRYEDLK DDIETNLKRL ATFLELPFTE EEERKGVVKA IAELCSFENL 301: KKLEVNKSNK SIKNFENRFL FRKGEVSDWV NYLSPSQVER LSALVDDKLG GSGLTFRLS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)