AT1G64660.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : methionine gamma-lyase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a functional methionine gamma-lyase, a cytosolic enzyme catalyzes the degradation of methionine into methanethiol, alpha-ketobutyrate and ammonia. The catabolism of excess methionine is important to methionine homeostasis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
methionine gamma-lyase (MGL); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Cys/Met metabolism, pyridoxal phosphate-dependent enzyme (InterPro:IPR000277), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2 (InterPro:IPR015422); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein (TAIR:AT3G01120.1); Has 19547 Blast hits to 19544 proteins in 2474 species: Archae - 216; Bacteria - 11847; Metazoa - 211; Fungi - 771; Plants - 270; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6232 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:24028977..24030537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47823.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 441 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAHFLETQEP LVFSGKKRND RDDEDGDALV AKKSALAVCD ADPAAAIANI RHEFGEHGGV NMSIEASATF TVMEPDTMRR MFTGELGPDN DFYVYSRHFN 101: PTVLNLSRQM AALEGTQAAY CTSSGMSAIS SVMLQLCSSG GHVVAASTLY GGTHALLSHF LPRTCNITTS FVDITDHGAV ANAIVEGRTQ VLYFESVANP 201: TLTVADIPEL SRMAHEKGVT VVVDNTFAPM VLSPAKLGAD VVVHSISKFI SGGADIIAGA VCGSENLVKE MMDLRGGSLM LLGPTMNAKV AFELSERIPH 301: LGLRMREHSH RAQVYAERMR DLGMKVIYPG LETHPQHKLF KGMVNRDYGY GGLLSIDMET EEKANKLMAY LQNATQFGFM AVSLGYYETL MSCSGSSTSS 401: ELDPSQKEAA GISPGLVRMS VGYVGTLEQK WTQFEKAFLR M |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)