AT1G10070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : branched-chain amino acid transaminase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a chloroplast branched-chain amino acid aminotransferase. Complements the yeast leu/iso-leu/val auxotrophy mutant. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
branched-chain amino acid transaminase 2 (BCAT-2); FUNCTIONS IN: branched-chain-amino-acid transaminase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: branched chain family amino acid metabolic process, metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aminotransferase, class IV (InterPro:IPR001544), Aminotransferase, class IV, conserved site (InterPro:IPR018300), Branched-chain amino acid aminotransferase II (InterPro:IPR005786); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: branched-chain amino acid aminotransferase 5 / branched-chain amino acid transaminase 5 (BCAT5) (TAIR:AT5G65780.1); Has 12153 Blast hits to 12153 proteins in 2497 species: Archae - 154; Bacteria - 7615; Metazoa - 264; Fungi - 416; Plants - 254; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3450 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3288255..3290164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42593.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 388 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIKTITSLRK TLVLPLHLHI RTLQTFAKYN AQAASALREE RKKPLYQNGD DVYADLDWDN LGFGLNPADY MYVMKCSKDG EFTQGELSPY GNIQLSPSAG 101: VLNYGQAIYE GTKAYRKENG KLLLFRPDHN AIRMKLGAER MLMPSPSVDQ FVNAVKQTAL ANKRWVPPAG KGTLYIRPLL MGSGPILGLG PAPEYTFIVY 201: ASPVGNYFKE GMAALNLYVE EEYVRAAPGG AGGVKSITNY APVLKALSRA KSRGFSDVLY LDSVKKKYLE EASSCNVFVV KGRTISTPAT NGTILEGITR 301: KSVMEIASDQ GYQVVEKAVH VDEVMDADEV FCTGTAVVVA PVGTITYQEK RVEYKTGDES VCQKLRSVLV GIQTGLIEDN KGWVTDIN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)