AT4G37580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.993 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
involved in apical hook development. putative N-acetyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
HOOKLESS 1 (HLS1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GCN5-related N-acetyltransferase, C-terminal (InterPro:IPR022610), GCN5-related N-acetyltransferase (InterPro:IPR000182), Acyl-CoA N-acyltransferase (InterPro:IPR016181); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein (TAIR:AT2G23060.1); Has 145 Blast hits to 145 proteins in 38 species: Archae - 22; Bacteria - 20; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 101; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:17658932..17660564 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44936.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 403 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTVVREYDPT RDLVGVEDVE RRCEVGPSGK LSLFTDLLGD PICRIRHSPS YLMLVAEMGT EKKEIVGMIR GCIKTVTCGQ KLDLNHKSQN DVVKPLYTKL 101: AYVLGLRVSP FHRRQGIGFK LVKMMEEWFR QNGAEYSYIA TENDNQASVN LFTGKCGYSE FRTPSILVNP VYAHRVNVSR RVTVIKLEPV DAETLYRIRF 201: STTEFFPRDI DSVLNNKLSL GTFVAVPRGS CYGSGSGSWP GSAKFLEYPP ESWAVLSVWN CKDSFLLEVR GASRLRRVVA KTTRVVDKTL PFLKLPSIPS 301: VFEPFGLHFM YGIGGEGPRA VKMVKSLCAH AHNLAKAGGC GVVAAEVAGE DPLRRGIPHW KVLSCDEDLW CIKRLGDDYS DGVVGDWTKS PPGVSIFVDP 401: REF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)