AT4G33040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Thioredoxin superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Thioredoxin superfamily protein; FUNCTIONS IN: electron carrier activity, protein disulfide oxidoreductase activity; INVOLVED IN: cell redox homeostasis; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutaredoxin-like, plant II (InterPro:IPR011905), Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Glutaredoxin (InterPro:IPR002109), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Thioredoxin superfamily protein (TAIR:AT5G11930.1); Has 1149 Blast hits to 1147 proteins in 175 species: Archae - 0; Bacteria - 20; Metazoa - 257; Fungi - 124; Plants - 712; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 36 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:15940779..15941213 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15567.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 144 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMQELGLQRF SNDVVRLDLT PPSQTSSTSL SIDEEESTEA KIRRLISEHP VIIFSRSSCC MCHVMKRLLA TIGVIPTVIE LDDHEVSSLP TALQDEYSGG 101: VSVVGPPPAV FIGRECVGGL ESLVALHLSG QLVPKLVQVG ALWV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)