AT4G30960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.989 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : SOS3-interacting protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes CBL-interacting protein kinase 6 (CIPK6). Required for development and salt tolerance. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
SOS3-interacting protein 3 (SIP3); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), NAF/FISL domain (InterPro:IPR018451), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), NAF domain (InterPro:IPR004041), CBL-interacting protein kinase (InterPro:IPR020660), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CBL-interacting protein kinase 20 (TAIR:AT5G45820.1); Has 129448 Blast hits to 127362 proteins in 4509 species: Archae - 159; Bacteria - 15496; Metazoa - 47121; Fungi - 13315; Plants - 31167; Viruses - 523; Other Eukaryotes - 21667 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15067400..15068725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49359.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 441 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVGAKPVENG SDGGSSTGLL HGRYELGRLL GHGTFAKVYH ARNIQTGKSV AMKVVGKEKV VKVGMVDQIK REISVMRMVK HPNIVELHEV MASKSKIYFA 101: MELVRGGELF AKVAKGRLRE DVARVYFQQL ISAVDFCHSR GVYHRDLKPE NLLLDEEGNL KVTDFGLSAF TEHLKQDGLL HTTCGTPAYV APEVILKKGY 201: DGAKADLWSC GVILFVLLAG YLPFQDDNLV NMYRKIYRGD FKCPGWLSSD ARRLVTKLLD PNPNTRITIE KVMDSPWFKK QATRSRNEPV AATITTTEED 301: VDFLVHKSKE ETETLNAFHI IALSEGFDLS PLFEEKKKEE KREMRFATSR PASSVISSLE EAARVGNKFD VRKSESRVRI EGKQNGRKGK LAVEAEIFAV 401: APSFVVVEVK KDHGDTLEYN NFCSTALRPA LKDIFWTSTP A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)