AT5G11930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.735 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Thioredoxin superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Thioredoxin superfamily protein; FUNCTIONS IN: electron carrier activity, protein disulfide oxidoreductase activity; INVOLVED IN: cell redox homeostasis; EXPRESSED IN: 11 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutaredoxin-like, plant II (InterPro:IPR011905), Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Glutaredoxin (InterPro:IPR002109), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Thioredoxin superfamily protein (TAIR:AT4G33040.1); Has 825 Blast hits to 825 proteins in 90 species: Archae - 0; Bacteria - 22; Metazoa - 106; Fungi - 2; Plants - 671; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 24 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3845165..3845611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15710.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 148 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKTMRGLRNC SNDAVTLDLT VHPPPPPPLP PPAPSTVSSS TASTSLSFDE EETSESKIGR LISEHPVIIF TRFSSCCMCH VMKKLLSTVG VHPTVIEIDD 101: GEIAYLAVEA APVLFIGGTC VGGFESLVAL HLSGQLIPRL VEVGALWA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)