AT4G32690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.843 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : hemoglobin 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a hemoglobin (Hb) with a central domain similar to the 'truncated Hbs of bacteria, protozoa and fungi. The 3D structure of these types of Hbs is a 2-on-2 arrangement of alpha-helices as opposed to the 3-on-3 arrangement of the standard globin fold. This type of Hb is not found in animals or yeast. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
hemoglobin 3 (GLB3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Globin, truncated bacterial-like (InterPro:IPR001486), Globin-like (InterPro:IPR009050), Globin (InterPro:IPR012292); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15765486..15766862 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20197.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 175 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQSLQDKASV LSGVDQAEAF AIDESNLFDK LGLQTFINLS TNFYTRVYDD EEEWFQSIFS NSNKEDAIQN QYEFFVQRMG GPPLYSQRKG HPALIGRHRP 101: FPVTHQAAER WLEHMQNALD DSVDIDQDSK IKMMKFFRHT AFFLVAGNEL KNQNEKPKHK PQCACKHAAN KPAEE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)