AT4G32320.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ascorbate peroxidase 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cytosolic ascorbate peroxidase APX6. Ascorbate peroxidases are enzymes that scavenge hydrogen peroxide in plant cells. Eight types of APX have been described for Arabidopsis: three cytosolic (APX1, APX2, APX6), two chloroplastic types (stromal sAPX, thylakoid tAPX), and three microsomal (APX3, APX4, APX5) isoforms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ascorbate peroxidase 6 (APX6); FUNCTIONS IN: L-ascorbate peroxidase activity, peroxidase activity, heme binding; INVOLVED IN: response to oxidative stress, oxidation reduction; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Plant ascorbate peroxidase (InterPro:IPR002207), Peroxidases heam-ligand binding site (InterPro:IPR019793), Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial (InterPro:IPR002016), Peroxidase, active site (InterPro:IPR019794); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ascorbate peroxidase 2 (TAIR:AT3G09640.2); Has 8064 Blast hits to 8032 proteins in 1269 species: Archae - 53; Bacteria - 2233; Metazoa - 2; Fungi - 806; Plants - 4037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 933 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15602777..15605234 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36241.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 329 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTTTTASLVK TFLFRCDSFS SFKFKCKFES PAKTRLLSPA TEKHVVRSSR AWRIRCLSDD PGSSHVFVAS RRKMVVLLST VQLLSHMLPQ NGNAAEIYPV 101: MQNEIRKVVT KGKAAGVLRL VFHDAGTFEL DDHSGGINGS IAYELERPEN IGLKKSLKVL AKAKVKVDEI QPVSWADMIS VAGSEAVSIC GGPTIPVVLG 201: RLDSAQPDPE GKLPPETLSA SGLKECFKRK GFSTQELVAL SGAHTIGSKG FGDPTVFDNA YYKILLEKPW TSTSKMTSMV GLPSDHALVQ DDECLRWVKR 301: YAEDQDKFFE DFTNAYIKLV NSGAKWNML |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)