AT4G29220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphofructokinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phosphofructokinase 1 (PFK1); FUNCTIONS IN: 6-phosphofructokinase activity; INVOLVED IN: glycolysis; LOCATED IN: cytosol, 6-phosphofructokinase complex, plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyrophosphate-dependent phosphofructokinase TP0108 (InterPro:IPR012004), Phosphofructokinase (InterPro:IPR000023); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphofructokinase 3 (TAIR:AT4G26270.1); Has 7864 Blast hits to 7397 proteins in 2157 species: Archae - 28; Bacteria - 5161; Metazoa - 680; Fungi - 324; Plants - 394; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1275 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14403621..14406071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51994.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 473 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSSVPNSDR KIVTGPAGYI LEDVPHFSDD FPDHPTYPNP LQDNAAYSVV KQYFVDEDDT VPQKIVVHPD SPRGTHFRRA GPRQRVYFES DDVLACIVTC 101: GGLCPGLNTV IREIVCGLSY MYGVKRILGI DGGYRGFYAR NTIHLDLKTV NDIHRSGGTI LGTSRGGHNT TKIVDSIQDR GINQVYIIGG DGSQKGAAAI 201: FEEIRKRKLK VAVAGIPKTI DNDIPIIDRS FGFDTAVEEA QRAINAAHVE ATSFENGIGL VKLMGRYSGF IAMHATLASR DVDCCLIPES PFFLEGSGGL 301: FEFIDKRLKE SGHMVIVIAE GAGQDLLSES MKESTTLKDA SGNKLLQDIG LWISQRIKDH FAKKMTLTLK YIDPTYMIRA VPSNASDNVC CTLLAQSAVH 401: GVMAGYNGFT VGLVNGRHTY IPFNRITEKQ NKVVITDRMW ARLLSSTNQP SFMKQADKIH SNQLVGEPGT MKW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)