AT4G23890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF3252 (InterPro:IPR021659); Has 287 Blast hits to 287 proteins in 81 species: Archae - 0; Bacteria - 118; Metazoa - 12; Fungi - 6; Plants - 40; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 111 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:12420593..12421345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27728.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 250 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSSITIPT IRTPIHRSKF LGQTHQFSTV NRSVFPPPKQ QSKLYQVKAM GKFNLWEVMG GRGLCNGEKG IEKELQRNIE DEQETSKAEN NETERESDDS 101: NLSFKVPEDG FEKEMMGLTG GFPGGEKGLK TFIEKNPPPP PPPPPAKQGS DASAVATDKK PKAPKLPLLM PGMIAIVKNQ NSPYHMYCGI VQRITDGKAG 201: VLFEGGNWDR LITFRLEELE RREKGPPGKN PKSCILEPLI EQMQKEEAAP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)