AT4G21220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Trimeric LpxA-like enzymes superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Trimeric LpxA-like enzymes superfamily protein; FUNCTIONS IN: transferase activity; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Trimeric LpxA-like (InterPro:IPR011004); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Trimeric LpxA-like enzymes superfamily protein (TAIR:AT4G05210.1); Has 11236 Blast hits to 11169 proteins in 1804 species: Archae - 57; Bacteria - 7331; Metazoa - 7; Fungi - 9; Plants - 63; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3769 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:11316978..11319067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32332.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 304 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAATLWRLYS KSICNSLQGI ILNKPFIQKQ LLLSSRTRSL SFSSDSQFGS ATAEVCSNTG LKTGGGIIVK EGFLRWENGG GTCHSSAQIY SSALVEFGAV 101: VHEKAVLGAE VHVGSGTVIG PSVDIGPSTR IGYNVSISNC SIGDSCVIHN GVCIGQDGFG FYVDEHGNMV KKPQTLNVKI GNRVEIGANT CIDRGSWRET 201: VIEDDTKIDN LVQIGHNVII GKCCLLCGQV GIAGSVTIGD YVALGGRAAV RDHVSIVSKV RLAANSCVTR NITEPGDFGG FPAVPIHEWR KQIVRAQIAN 301: KREI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)