AT4G19070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.746 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Putative membrane lipoprotein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Putative membrane lipoprotein; Has 124 Blast hits to 75 proteins in 28 species: Archae - 2; Bacteria - 7; Metazoa - 8; Fungi - 0; Plants - 50; Viruses - 47; Other Eukaryotes - 10 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:10446770..10448079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18311.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 171 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVLMIIKGIF RRYEKWNPVH PTYGAFWGMG IGIGCGVGWG PGFGPEVIGY VGAGCGVGFS VGITLAGLGI GLPTNFLLAA PYNTVEATRK GAFNFFGKNL 101: STNGWSDLMP QIAGLQRQVS EICSGFNKKP HLNNAIDLKS FPLFISHDCG KFGSHLLHVR KGSEDNKSSA M |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)