AT4G04850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : K+ efflux antiporter 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Putative potassium transporter family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
K+ efflux antiporter 3 (KEA3); FUNCTIONS IN: potassium:hydrogen antiporter activity, potassium ion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: potassium ion transport, cation transport, metabolic process, transmembrane transport; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cation/H+ exchanger (InterPro:IPR006153), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Regulator of K+ conductance, N-terminal (InterPro:IPR003148); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: K+ efflux antiporter 1 (TAIR:AT1G01790.1); Has 8794 Blast hits to 8786 proteins in 1953 species: Archae - 296; Bacteria - 7320; Metazoa - 54; Fungi - 26; Plants - 301; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 797 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:2453174..2456891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69050.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 637 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAISTMLGSI SCCPSPKGYE MVKQHSVRLK HCVFTVKSSV PVYSEGVNDG IKLHSFGNLV KKKVFLDTSK RFYFQGRWSE SSGRRVETYA GVDVASAVDV 101: INDLGFDTLT FLMVTVIIVP AFRILKASPI LGFFFAGVVL NQFGLIRNLT DVKVLSEWGI LFLLFEMGLE LSLARLKALA KFAFGMGLTQ VLLCTAAFTA 201: FELPPNGAIG TKILEFLFHS RPDLVNIRSI DEAVVIGAAL SLSSSAFVLQ LLAEKGELPT RFGSATLGIL LLQDIAVVPL LVILPVLESQ DIGGESIWPM 301: LAKESAKALG GLGILSLGGK FFLRRIFEVV AETRSSEAFV ALCLLTVAGT SLVTQWLGFS DTLGAFLAGA LLAETNFRTQ IEADIRPFRG LLLGLFFVTT 401: GTSIDMEVLF REWPNVLSLL GGLIVIKTLI ITAIGPRVGL TIQESVRVGF LLSQGGEFAF VVFSLANRLG VLPNELNKLL IIVVVLSMAL TPYLNQLGRK 501: AADFLDERLD PGEKIGEDVN FDVSESIVII GFGQMGQVLA NFLSTPLVSD SDLVGWPYIG FDLNPAVVKE SRKLGFPILY GDGSRPSVLQ SAGVSSPKAI 601: MIMYKGKKRT TEAVQRLRLA FPGVISLFLL PFVNKIV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)