AT4G01310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal L5P family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal L5P family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L5 (InterPro:IPR002132), Ribosomal protein L5, conserved site (InterPro:IPR020929), Ribosomal protein L5, C-terminal (InterPro:IPR020928), Ribosomal protein L5, N-terminal (InterPro:IPR020927); Has 9219 Blast hits to 9219 proteins in 3016 species: Archae - 312; Bacteria - 5408; Metazoa - 222; Fungi - 280; Plants - 343; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2654 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:544166..545480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28345.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 262 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASPSLLQSS ASSFHGRFSP LAAPSSARML SPPLRNVVKV SASGTVLVEK SEAEKTQRLK TAYLERIIPA LKEEFKYVNI HQVPKVQKIV VNCGIGDAAQ 101: NDKGLEAAMK DIALITGQKP IKTRARASIA TFKIREDQPL GIAVTLRGDV MYSFLDRLIN LALPRTRDFQ GVSPSSFDGN GNYSIGVKDQ GVFPEIRFDA 201: VGKTRGMDVC ISTTAKSDQE GQKLLALMGM PFREGGGGST GAIVRKKKLK SHHFDAKGKG KR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)