AT4G01100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : adenine nucleotide transporter 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
adenine nucleotide transporter 1 (ADNT1); FUNCTIONS IN: binding, ADP transmembrane transporter activity, ATP transmembrane transporter activity, AMP transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: mitochondrion, mitochondrial inner membrane, plasma membrane, plastid, membrane; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial carrier protein (InterPro:IPR002067), Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mitochondrial substrate carrier family protein (TAIR:AT5G51050.1); Has 27989 Blast hits to 14393 proteins in 468 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 12077; Fungi - 8125; Plants - 4770; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3015 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:477411..479590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38327.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 352 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASEDVKRTE SAAVSTIVNL AEEAREGVKA PSYAFKSICK SLFAGGVAGG VSRTAVAPLE RMKILLQVQN PHNIKYSGTV QGLKHIWRTE GLRGLFKGNG 101: TNCARIVPNS AVKFFSYEQA SNGILYMYRQ RTGNENAQLT PLLRLGAGAT AGIIAMSATY PMDMVRGRLT VQTANSPYQY RGIAHALATV LREEGPRALY 201: RGWLPSVIGV VPYVGLNFSV YESLKDWLVK ENPYGLVENN ELTVVTRLTC GAIAGTVGQT IAYPLDVIRR RMQMVGWKDA SAIVTGEGRS TASLEYTGMV 301: DAFRKTVRHE GFGALYKGLV PNSVKVVPSI AIAFVTYEMV KDVLGVEFRI SD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)