AT4G00900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 ASURE: endoplasmic reticulum What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ER-type Ca2+-ATPase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Type IIA (SERCA-type) Ca2+ ATPase, catalyzes the efflux of calcium from the cytoplasm. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ER-type Ca2+-ATPase 2 (ECA2); FUNCTIONS IN: calcium-transporting ATPase activity; INVOLVED IN: calcium ion transport; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, P-type, ATPase-associated domain (InterPro:IPR008250), ATPase, P-type, calcium-transporting (InterPro:IPR005782), ATPase, P-type cation-transporter, N-terminal (InterPro:IPR004014), ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit (InterPro:IPR006069), Haloacid dehalogenase-like hydrolase (InterPro:IPR005834), ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter (InterPro:IPR001757), ATPase, P-type phosphorylation site (InterPro:IPR018303), ATPase, P-type cation-transporter, C-terminal (InterPro:IPR006068); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ER-type Ca2+-ATPase 1 (TAIR:AT1G07810.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:382690..386226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 115836.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1054 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MEEEKSFSAW SWSVEQCLKE YKTRLDKGLT SEDVQIRRQK YGFNELAKEK GKPLWHLVLE QFDDTLVKIL LGAAFISFVL AFLGEEHGSG SGFEAFVEPF 0101: VIVLILILNA VVGVWQESNA EKALEALKEM QCESAKVLRD GNVLPNLPAR ELVPGDIVEL NVGDKVPADM RVSGLKTSTL RVEQSSLTGE AMPVLKGANL 0201: VVMDDCELQG KENMVFAGTT VVNGSCVCIV TSIGMDTEIG KIQRQIHEAS LEESETPLKK KLDEFGSRLT TAICIVCVLV WMINYKNFVS WDVVDGYKPV 0301: NIKFSFEKCT YYFKIAVALA VAAIPEGLPA VITTCLALGT RKMAQKNAIV RKLPSVETLG CTTVICSDKT GTLTTNQMSA TEFFTLGGKT TTTRVFSVSG 0401: TTYDPKDGGI VDWGCNNMDA NLQAVAEICS ICNDAGVFYE GKLFRATGLP TEAALKVLVE KMGIPEKKNS ENIEEVTNFS DNGSSVKLAC CDWWNKRSKK 0501: VATLEFDRVR KSMSVIVSEP NGQNRLLVKG AAESILERSS FAQLADGSLV ALDESSREVI LKKHSEMTSK GLRCLGLAYK DELGEFSDYS SEEHPSHKKL 0601: LDPSSYSNIE TNLIFVGVVG LRDPPREEVG RAIEDCRDAG IRVMVITGDN KSTAEAICCE IRLFSENEDL SQSSFTGKEF MSLPASRRSE ILSKSGGKVF 0701: SRAEPRHKQE IVRMLKEMGE IVAMTGDGVN DAPALKLADI GIAMGITGTE VAKEASDMVL ADDNFSTIVS AVAEGRSIYN NMKAFIRYMI SSNVGEVISI 0801: FLTAALGIPE CMIPVQLLWV NLVTDGPPAT ALGFNPADID IMKKPPRKSD DCLIDSWVLI RYLVIGSYVG VATVGIFVLW YTQASFLGIS LISDGHTLVS 0901: FTQLQNWSEC SSWGTNFTAT PYTVAGGLRT IAFENNPCDY FTLGKVKPMT LSLTVLVAIE MFNSLNALSE DNSLLTMPPW RNPWLLVAMT VSFALHCVIL 1001: YVPFLANVFG IVPLSFREWF VVILVSFPVI LIDEALKFIG RCRRTRIKKK IKTM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)