AT3G59350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein tyrosine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008266), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT2G43230.1); Has 109714 Blast hits to 108538 proteins in 4342 species: Archae - 101; Bacteria - 13132; Metazoa - 40554; Fungi - 8771; Plants - 31432; Viruses - 298; Other Eukaryotes - 15426 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:21932930..21934883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45660.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 408 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYPMDSDYHR RGLVANDRSP AQFVRLDKPR AVDDLYIGKR EKMRRWLCCA CHVEEPYHSS ENEHLRSPKH HNDFGHHTRK PQAAVKPDAL KEPPSIDVPA 101: LSLDELKEKT DNFGSKSLIG EGSYGRAYYA TLKDGKAVAV KKLDNAAEPE SNVEFLTQVS RVSKLKHDNF VELFGYCVEG NFRILAYEFA TMGSLHDILH 201: GRKGVQGAQP GPTLDWIQRV RIAVDAARGL EYLHEKVQPA VIHRDIRSSN VLLFEDFKAK IADFNLSNQS PDMAARLHST RVLGTFGYHA PEYAMTGQLT 301: QKSDVYSFGV VLLELLTGRK PVDHTMPRGQ QSLVTWATPR LSEDKVKQCV DPKLKGEYPP KAVAKLAAVA ALCVQYESEF RPNMSIVVKA LQPLLRSSTA 401: AAVPVQEA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)