AT3G56620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF6, transmembrane (InterPro:IPR000620); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein (TAIR:AT2G40900.1); Has 3973 Blast hits to 3961 proteins in 822 species: Archae - 18; Bacteria - 2149; Metazoa - 8; Fungi - 0; Plants - 1241; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 557 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:20972696..20974495 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41349.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 377 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLKMSESAK PYFAMVCLQF GYAGMNLVTK VVLDRGMSHY VLVAYRNAFA TAAIAPFALL SERKVRPKMT FPIFMQIFVL ALLGPLIDQN LYYAGLKLTS 101: PTFAGAVTNI VPALTFIISI ICRMEKVEMR KVRFQAKVVG TLVIVVGAML MILFKIPLIT FLRSHLTGHA LSPAGEDYLK ATVFLLIASF SWASFFVLQA 201: ATLKRYSSHL SLSTMVCFMG TLQSTALTFV MEPNLSAWNI GFDMNLLASA YAGIMSSSIA YYVQGMMTKQ KSVIFVTAFN PLVVIIGSII GFLILNQTLN 301: LGGVLGMAIL VVGVCTVLWG KEGDIDEEEN IEEKFVEIVK CCNRCDIKVL SMMPRIDEEV DVEMQSAGTA KVAVGFS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)