AT3G52990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pyruvate kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pyruvate kinase family protein; FUNCTIONS IN: pyruvate kinase activity, potassium ion binding, magnesium ion binding, catalytic activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion, glycolysis; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: guard cell, cultured cell, leaf; EXPRESSED DURING: seedling growth; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core (InterPro:IPR015813), Pyruvate kinase, alpha/beta (InterPro:IPR015794), Pyruvate kinase, beta-barrel-like (InterPro:IPR011037), Pyruvate kinase (InterPro:IPR001697), Pyruvate kinase, C-terminal-like (InterPro:IPR015795), Pyruvate kinase, barrel (InterPro:IPR015793); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyruvate kinase family protein (TAIR:AT2G36580.1); Has 9836 Blast hits to 9793 proteins in 2683 species: Archae - 167; Bacteria - 5933; Metazoa - 534; Fungi - 219; Plants - 549; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2434 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19649046..19652237 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57498.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 527 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MHSSHLLLEE PIRMASILEP SKSSFFPALT KIVGTLGPKS RSVEALSGCL KAGMSVARFD FSWGDADYHQ ETLDNLKVAV RSTKKLCAVM LDTVGPELQV 101: INKSEKAITL KADGLVTLTP NQDQEASSEV LPINFNGLAK AVKKGDTIFV GQYLFTGSET TSVWLEVDEV KGDDVICLSR NAATLAGSLF TLHSSQVHID 201: LPTLTEKDKE VISTWGVQNK IDFLSLSYCR HAEDVRQTRE MLKKLGDLSQ TQIFAKIENV EGLTHFDEIL QEADGIILSR GNLGIDLPPE KVFLFQKAAL 301: YKCNMAGKPA VLTRVVDSMT DNLRPTRAEA TDVANAVLDG SDAILLGAET LRGLYPVETI STVGRICAEA EKVFNQDLYF KKTVKYVGEP MTHLESIASS 401: AVRAAIKVKA SVIICFTSSG RAARLIAKYR PTMPVISVVI PRVKTNQLKW SFSGAFEARQ SLIVRGLFPM LADPRHPAES TSATNESVLK VALDHGKHAG 501: VIKSHDRVVV CQKVGDASVV KIIELED |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)