AT4G29130.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FP Images |
onion epidermal cell layer (peroxisomal marker) v1
onion epidermal cell layer (peroxisomal marker) v2
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : hexokinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a hexokinase (HXK1) in the plant glucose-signaling network. Functions as a glucose sensor to interrelate nutrient, light, and hormone signaling networks for controlling growth and development in response to the changing environment. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
hexokinase 1 (HXK1); FUNCTIONS IN: fructokinase activity, hexokinase activity, glucokinase activity, zinc ion binding, ATP binding; INVOLVED IN: sugar mediated signaling pathway, hexose catabolic process, glucose mediated signaling pathway, programmed cell death; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Hexokinase, N-terminal (InterPro:IPR022672), Hexokinase, conserved site (InterPro:IPR019807), Hexokinase, C-terminal (InterPro:IPR022673), Hexokinase (InterPro:IPR001312); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: hexokinase 2 (TAIR:AT2G19860.1); Has 2426 Blast hits to 2148 proteins in 325 species: Archae - 0; Bacteria - 92; Metazoa - 1300; Fungi - 606; Plants - 290; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 138 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14352338..14354865 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53710.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 496 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKVAVGATV VCTAAVCAVA VLVVRRRMQS SGKWGRVLAI LKAFEEDCAT PISKLRQVAD AMTVEMHAGL ASDGGSKLKM LISYVDNLPS GDEKGLFYAL 101: DLGGTNFRVM RVLLGGKQER VVKQEFEEVS IPPHLMTGGS DELFNFIAEA LAKFVATECE DFHLPEGRQR ELGFTFSFPV KQTSLSSGSL IKWTKGFSIE 201: EAVGQDVVGA LNKALERVGL DMRIAALVND TVGTLAGGRY YNPDVVAAVI LGTGTNAAYV ERATAIPKWH GLLPKSGEMV INMEWGNFRS SHLPLTEFDH 301: TLDFESLNPG EQILEKIISG MYLGEILRRV LLKMAEDAAF FGDTVPSKLR IPFIIRTPHM SAMHNDTSPD LKIVGSKIKD ILEVPTTSLK MRKVVISLCN 401: IIATRGARLS AAGIYGILKK LGRDTTKDEE VQKSVIAMDG GLFEHYTQFS ECMESSLKEL LGDEASGSVE VTHSNDGSGI GAALLAASHS LYLEDS |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)