AT3G46780.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : plastid transcriptionally active 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
plastid transcriptionally active 16 (PTAC16); FUNCTIONS IN: binding, catalytic activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), NmrA-like (InterPro:IPR008030); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein (TAIR:AT3G18890.1); Has 1243 Blast hits to 1093 proteins in 359 species: Archae - 5; Bacteria - 555; Metazoa - 73; Fungi - 75; Plants - 168; Viruses - 22; Other Eukaryotes - 345 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:17228766..17231021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54361.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 510 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSSTSFPL TTAPPQGVRF NRRKPRLTVW AKQTAFQLGK TKGDDDSEGK QKGKNPFQFD FGKLPDMKSL IPVVTNPSTG LVFGNNRKKD PGTIFVAGAT 101: GQAGIRIAQT LLQRGFSVRA GVPDLGAAQD LARVAATYKI LSNDEVKRLN AVQSPFQDAE SIAKAIGNAT KVVVTVGATE NGPDAQVSTS DALLVVQAAE 201: LAGVSHVAIV YDGTISGSTY NVLDGITSFF GNLFAKSQPL TISDLIEKVA QTDVAYTLIK TSLTEDFSPE KAYNVVVSAE GSNSGSGSSS SEAYKVPKLK 301: IASLVADIFA NTAVAENKVV EVSTDPSAPS RPVDELFSVI PEDGRRKVYA DAIARERAEE EAKVAADKAR EAAEAAKEFE KQMQKLSEKE AEAASLAEDA 401: QQKADAVGVT VDGLFNKAKD ISSGLSWNKL GSQFATAIQN ASETPKVQVA TVRGQAKARN LPPKKAVVKQ RPSSPFASKP KEERPKKPEK EVRKVFGGLF 501: KQETIYIDDD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)