AT1G08380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : photosystem I subunit O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes subunit O of photosystem I. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
photosystem I subunit O (PSAO); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: response to salt stress, photosynthesis, light harvesting in photosystem I; LOCATED IN: thylakoid, photosystem I, chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Photosystem I PsaO (InterPro:IPR017498); Has 161 Blast hits to 161 proteins in 28 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 159; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2641004..2641739 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15144.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 140 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAATFATPST VIGLGGSSIT TKPFSSSFLK PTLSAKNPLR LAGASGGRVT CFERNWLRRD LNVVGFGLIG WLAPSSIPAI NGKSLTGLFF DSIGTELAHF 101: PTPPALTSQF WLWLVTWHLG LFLCLTFGQI GFKGRTEDYF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)