AT4G28750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Photosystem I reaction centre subunit IV / PsaE protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
mutant has Decreased effective quantum yield of photosystem II; Pale green plants; Reduced growth rate; Subunit E of Photosystem I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PSA E1 KNOCKOUT (PSAE-1); FUNCTIONS IN: catalytic activity; INVOLVED IN: response to salt stress; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Photosystem I reaction centre subunit IV/PsaE (InterPro:IPR003375), Electron transport accessory protein (InterPro:IPR008990); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: photosystem I subunit E-2 (TAIR:AT2G20260.1); Has 449 Blast hits to 449 proteins in 133 species: Archae - 0; Bacteria - 180; Metazoa - 5; Fungi - 0; Plants - 90; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 171 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14202951..14203888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14967.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 143 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMTTASTVF VLPANVTSVA GASSSRSSVS FLPMRNAGSR LVVRAAEDPA PASSSSKDSP AAAAAPDGAT ATKPKPPPIG PKRGSKVKIL RRESYWFKNV 101: GSVVAVDQDP KTRYPVVVRF AKVNYANIST NNYALDEVEE VAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)