AT3G45420.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.912 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 10 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Legume lectin, beta chain (InterPro:IPR001220), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein (TAIR:AT3G45410.1); Has 119428 Blast hits to 117955 proteins in 4409 species: Archae - 94; Bacteria - 14054; Metazoa - 43305; Fungi - 10245; Plants - 34245; Viruses - 408; Other Eukaryotes - 17077 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:16657263..16659266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74101.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 667 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDCRLHLVLF FSCVCLICLS GQQETGFVYN GFHQEDLFID GIAMILPGGL LQLTNASQLK IGHAFFKQPF GFDPSSSLSF YTHFVCALVP PKFGAEVGHG 101: MAFVVSPSMN FSHAFPTQYL GVFNSSTNVT SSSHLLAIEL DTVETVDFHD LEKAHVGIDV NNPISIESAL PSYFSDALGK NISINLVSGE PVQVWIDYDG 201: SLLNVTLAPI EIQKPNRPLI SRDINLSEIF QDKMYIGFSG SNGRLTSNQY ILGWSFSKSK EFMQSLDLSK LPQAPIPRNE QAPVPREEKK KLHPLLIGLV 301: ILLVIPVLMV LGGVYWYRRK KYAEVKESWE KEYGPHRYSY KSLYKATNGF VKDALVGKGG FGKVYKGTLP GGRHIAVKRL SHDAEQGMKQ FVAEVVTMGN 401: IQHRNLVPLL GYCRRKGELL LVSEYMSNGS LDQYLFYNQN PSPSWLQRIS ILKDIASALN YLHSGANPAV LHRDIKASNV MLDSEYNGRL GDFGMAKFQD 501: PQGNLSATAA VGTIGYMAPE LIRTGTSKET DVYAFGIFLL EVTCGRRPFE PELPVQKKYL VKWVCECWKQ ASLLETRDPK LGREFLSEEV EMVLKLGLLC 601: TNDVPESRPD MGQVMQYLSQ KQPLPDFSAD SPGIGGFMPV SVEPSSTIGI PDSSMHVTHS ILEGYGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)