AT3G44320.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.497 peroxisome 0.283 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nitrilase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
This enzyme catalyzes the hydrolysis of indole-3-acetonitrile (IAN) to indole-3-acetic acid (IAA) (EC 3.5.5.1) and IAN to indole-3-acetamide (IAM) at lower levels. It is the only one of the four Arabidopsis nitrilases whose mRNA levels are strongly induced when plants experience sulphur deprivation. This enzyme likely participates in other non-auxin-related metabolic pathways. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
nitrilase 3 (NIT3); FUNCTIONS IN: indole-3-acetonitrile nitrilase activity, nitrilase activity, indole-3-acetonitrile nitrile hydratase activity; INVOLVED IN: cellular response to sulfate starvation, response to cadmium ion, glucosinolate catabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase (InterPro:IPR003010), Nitrilase/cyanide hydratase, conserved site (InterPro:IPR000132); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nitrilase 1 (TAIR:AT3G44310.3); Has 7365 Blast hits to 7291 proteins in 1693 species: Archae - 150; Bacteria - 4836; Metazoa - 437; Fungi - 564; Plants - 330; Viruses - 11; Other Eukaryotes - 1037 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:15993419..15995493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38024.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 346 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSTEEMSSV KNTTQVIGVD PSSTVRVTIV QSSTVYNDTP ATLDKAEKFI VEAASKGAKL VLFPEAFIGG YPRGFRFGLA VGVHNEEGRD EFRNYHASAI 101: KVPGPEVERL AELAGKNNVH LVMGAIEKDG YTLYCTALFF SPQGQFLGKH RKVMPTSLER CIWGQGDGST IPVYDTPIGK IGAAICWENR MPLYRTALYA 201: KGIEIYCAPT ADYSLEWQAS MIHIAVEGGC FVLSAHQFCK RREFPEHPDY LFNDIVDTKE HDPTVSGGGS VIISPLGKVL AGPNYESEGL VTADLDLGDI 301: ARAKLYFDVV GHYSKPDIFN LTVNEHPKKP VTFMTKVEKA EDESNK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)