AT3G43600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.976 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aldehyde oxidase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an aldehyde oxidase. AAO2 does not appear to act on abscisic aldehyde in vitro but it is possible that it may function in abscisic acid biosynthesis when the activity of At2g27150 (AAO3), the primary abscisic aldehyde oxidase, is lost. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aldehyde oxidase 2 (AAO2); FUNCTIONS IN: aldehyde oxidase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; EXPRESSED IN: 16 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase (InterPro:IPR016208), Ferredoxin (InterPro:IPR001041), Molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding (InterPro:IPR002346), [2Fe-2S]-binding (InterPro:IPR002888), FAD-binding, type 2 (InterPro:IPR016166), CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal (InterPro:IPR005107), 2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site (InterPro:IPR006058), CO dehydrogenase flavoprotein-like, FAD-binding, subdomain 2 (InterPro:IPR016169), Aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase, a/b hammerhead (InterPro:IPR000674), Aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding (InterPro:IPR008274); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aldehyde oxidase 1 (TAIR:AT5G20960.2); Has 18530 Blast hits to 17817 proteins in 1279 species: Archae - 421; Bacteria - 11000; Metazoa - 1023; Fungi - 117; Plants - 281; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5688 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:15512778..15517375 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 144588.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1321 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MSLVFAINGQ RFELELSSVD PSTTLLEFLR YQTSFKSVKL SCGEGGCGAC VVLLSKFDPV LQKVEDFTVS SCLTLLCSVN HCNITTSEGL GNSRDGFHPI 0101: HKRLSGFHAS QCGFCTPGMS VSLFSALLDA DKSQYSDLTV VEAEKAVSGN LCRCTGYRPI VDACKSFASD VDIEDLGLNS FCRKGDKDSS SLTRFDSEKR 0201: ICTFPEFLKD EIKSVDSGMY RWCSPASVEE LSSLLEACKA NSNTVSMKLV AGNTSMGYYK DEREQNYDKY IDITRIPHLK EIRENQNGVE IGSVVTISKV 0301: IAALKEIRVS PGVEKIFGKL ATHMEMIAAR FIRNFGSIGG NLVMAQRKQF PSDMATILLA AGAFVNIMSS SRGLEKLTLE EFLERSPLEA HDLVLSIEIP 0401: FWHSETNSEL FFETYRAAPR PHGSALAYLN AAFLAEVKDT MVVNCRLAFG AYGTKHAIRC KEIEEFLSGK VITDKVLYEA ITLLGNVVVP EDGTSNPAYR 0501: SSLAPGFLFK FLHTLMTHPT TDKPSNGYHL DPPKPLPMLS SSQNVPINNE YNPVGQPVTK VGASLQASGE AVYVDDIPSP TNCLYGAFIY SKKPFARIKG 0601: IHFKDDLVPT GVVAVISRKD VPKGGKNIGM KIGLGSDQLF AEDFTTSVGE CIAFVVADTQ RHADAAVNLA VVEYETEDLE PPILSVEDAV KKSSLFDIIP 0701: FLYPQQVGDT SKGMAEADHQ ILSSEIRLGS QYVFYMETQT ALAVGDEDNC IVVYSSTQTP QYVQSSVAAC LGIPENNIRV ITRRVGGGFG GKSVKSMPVA 0801: TACALAAKKL QRPVRTYVNR KTDMIMTGGR HPMKITYSVG FKSTGKITAL ELEILIDAGA SYGFSMFIPS NLIGSLKKYN WGALSFDIKL CKTNLLSRAI 0901: MRSPGDVQGT YIAEAIIENI ASSLSLEVDT IRKINLHTHE SLALFYKDGA GEPHEYTLSS MWDKVGVSSK FEERVSVVRE FNESNMWRKR GISRVPIIYE 1001: VLLFATPGRV SVLSDGTIVV EIGGIELGQG LWTKVKQMTS YALGMLQCDG TEELLEKIRV IQSDSLSMVQ GNFTGGSTTS EGSCAAVRLC CETLVERLKP 1101: LMERSDGPIT WNELISQAYA QSVNLSASDL YTPKDTPMQY LNYGTAVSEV EVDLVTGQTT VLQTDILYDC GKSLNPAVDL GQIEGSFVQG LGFFMLEEYI 1201: EDPEGLLLTD STWTYKIPTV DTIPKQFNVE ILNGGCHEKR VLSSKASGEP PLLLAASVHC ATRQAVKEAR KQLCMWKGEN GSSGSAFQLP VPATMPVVKE 1301: LCGLDIIESY LEWKLHDNSN L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)