AT3G18040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.772 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MAP kinase 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with similarity to MAP kinases (MAPK9).Expressed preferentially in guard cells and appears to be involved in reactive oxygen species mediated ABA signaling. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MAP kinase 9 (MPK9); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MAP kinase 15 (TAIR:AT1G73670.1); Has 122703 Blast hits to 121413 proteins in 4361 species: Archae - 122; Bacteria - 13975; Metazoa - 45582; Fungi - 12439; Plants - 29950; Viruses - 578; Other Eukaryotes - 20057 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:6174800..6178150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58397.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 510 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDPHKKVALE TEFFTEYGEA SRYQIQEVIG KGSYGVVASA IDTHSGEKVA IKKINDVFEH VSDATRILRE IKLLRLLRHP DIVEIKHVML PPSRREFRDI 101: YVVFELMESD LHQVIKANDD LTPEHYQFFL YQLLRGLKFI HTANVFHRDL KPKNILANSD CKLKICDFGL ARVSFNDAPS AIFWTDYVAT RWYRAPELCG 201: SFFSKYTPAI DIWSIGCIFA EMLTGKPLFP GKNVVHQLDI MTDLLGTPPP EAIARIRNEK ARRYLGNMRR KPPVPFTHKF PHVDPLALRL LHRLLAFDPK 301: DRPSAEEALA DPYFYGLANV DREPSTQPIP KLEFEFERRK ITKEDVRELI YREILEYHPQ MLQEYLRGGE QTSFMYPSGV DRFKRQFAHL EENYGKGEKG 401: SPLQRQHASL PRERVPAPKK ENGSHNHDIE NRSIASLVTT LESPPTSQHE GSDYRNGTSQ TGYSARSLLK SASISASKCI GMKPRNKSEY GESNNDTVDA 501: LSQKVAALHT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)